基因组所乐成开发整合网络工具——iBIG
近日，北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室雷红星研究员，领导其团队乐成开发网页版整合网络工具——iBIG (integrative BIoloGy)，该研究结果《iBIG: An Integrative Network Tool for Supporting Human Disease Mechanism Studies》在Genomics, Proteomics & Bioinformatics (GPB) 2013年第3期Gene Regulatory Networks (GRN，基因调控网络) 专刊上宣布。该工具整合了多种基因相互作用和调控信息，生成的基因网络可以进行种种信息注释并在线直接完成可视化，这种网页版的可视化方法为网络的完善提供了极大的便当。
别的，该工具还提供了一个附件R软件包ArrayPro。利用该软件包中提供的一系列函数可以对微阵列数据进行预处理；可以寻找差别表达基因，由今生成的重要基因列表通�？杀挥米鱥BIG的基因输入；可以对基因列表进行功效富集剖析；还可以构建功效�？橥�，利用iBIG也可以将功效�？橥缭谙咧苯油瓿煽墒踊�。
为了展示iBIG的效用，雷红星研究员及其研究团队收集了54组人类常见疾病的微阵列数据，构建了基因和功效两个层面的网络。这两个层面的网络为人类疾病致病机理的研究提供了新的思路。
总的来说，iBIG是一个全新的网络构建和可视化工具，其特色在于整合了多种基因相互作用和调控信息，网页版的可视化方法，以及功效�？橥绲墓菇�。
iBIG链接：http://lei.big.ac.cn/ibig
R软件包ArrayPro链接：http://lei.big.ac.cn/download/open_download_page.
论文链接：http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1672022912001131
iBIG 架构图
