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基因组所完成鲤鱼基因组开端测定剖析

2010年3月 ,pg电子官网运用新一代高通量测序技术以及高性能的生物信息剖析 ,完成了鲤鱼基因组开端测定与剖析事情 ,获得了鲤鱼基因组高笼罩的基因组数据。“鲤鱼基因组计划”是基因组所与水爆发物应用基因组研究中心和黑龙江水产研究所联合开展的研究项目 ,目前项目进展顺利 ,是我国鱼类第一个全基因组测序计划 ,也是世界上第一个鲤科经济鱼类基因组计划。

本项目主要依托于基因组所基因组及生物信息学平台第二代高通量测序仪进行测序剖析事情 ,该平台拥有13台新一代高通量测序仪(SOLiD、Solexa和 454测序仪)、3台3730xl ,1台3130xl的测序规模 ,拥有凌驾10万亿次/秒的盘算能力和大于1000TB的存储。目前已经完成部分454shotgun文库段测序 ,总体数据已经抵达4乘的笼罩度 ,完成部分组织转录组的事情 ,为基因组注释提供参考。目前该项目正在加紧进行生物信息学的剖析 ,预计将比计划提前完成鲤鱼基因组框架图的事情。

科学家希望通过鲤鱼基因组测序及其序列剖析为研究养殖鱼类的生长、发育、滋生、遗传变异、疾病、与情况的相互用(包括抗逆能力)及其遗传改良提供重要的参考甚至指导信息。通过鲤鱼基因组的研究 ,可以获得与经济性状相关的基因 ,与疾病的爆发及免疫相关的基因等 ,为鲤鱼的遗传育种提供基础。

随着人和其它主要动植物基因组的破译 ,模式动物和经济动物基因组计划方兴未艾 ,越来越多的鱼类被提上议程 ,世界各国的科学家相继完成了一些鱼类的基因组测序和剖析事情 ,大都以本区域或者本国的鱼类产品为主 ,例如日本完成的青鳉鱼 ,挪威和加拿大配合完成的大西洋鲑等。作为我国鱼类中漫衍最广、品种最多、产量最高的鲤鱼基因组计划的开展 ,是我国水产科研步入现代科学先进行列的标记性事件 ,将对我国乃至世界水工业的生长爆发重要的影响。

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